技術名稱 上呼吸道病毒現形高手:利用深度學習模型來建立上呼吸道病毒序列基因型即時分析平台
計畫單位 中央研究院
計畫主持人 林仲彥
技術簡介
以大量由公有資料庫取得的上呼吸道病毒序列為基礎,結合其基因型資訊進行分類清洗,增加整體資料的精準度,及均化各個分類型別的資料筆數,透過第一層深度學習模型的建置,將主要的十一大類型先行分出,再結合細部分類模型如已建置完成的腸病毒分類模型,便可以快速辨別是否是與重症相關的病毒株,協助後續精準治療。
科學突破性
結合第三代高通量低單價之定序儀技術,可以得到大量上呼吸道病毒序列讀序,透過上呼吸道致病原線上智慧分類平台,將能在病毒感染初期(約三到五天內),及早發現所感染的類型,如屬高致病品系,便能提早準備,防止重症的發生,減少寶貴生命受損的機率,抵銷對醫療和社會經濟成本所造成的衝擊,進而實現預防醫學的目標。
產業應用性
未來將與相關醫療檢驗單位合作,實際測試,希望能將此一平台推至第一線診所與醫院、生技檢驗業者,還有病毒學研究社群與流病監控團隊,提供快速檢驗的可能性。同時,也希望透過這樣的自動分類系統,來建立健康人體上呼吸道常在菌與病毒之類型與組成,提供形成具保護作用之生態系統(Ecosystem)的重要參考依據。
關鍵字 上呼吸道 致病原 病毒 基因序列 人工智慧 深度學習 流感病毒 精準診斷 單分子即時定序 生物醫學
備註
上呼吸道病毒智慧分類平台:
http://symbiosis.iis.sinica.edu.tw/uvhunter/
腸病毒基因型人工智慧分型網站:
http://symbiosis.iis.sinica.edu.tw/Enterovirus/
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  • 林仲彥
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